Il Segretario Generale svolge compiti di collaborazione e funzione di assistenza giuridico - amministrativa nei confronti degli organi dell'Ente in ordine alla conformità dell'azione amministrativa alle leggi, allo Statuto ed ai Regolamenti, infatti partecipa con funzioni consultive, referenti e di assistenza alle riunioni del Consiglio e della Giunta e ne cura la verbalizzazione, definisce la corretta competenza del Consiglio Comunale e della Giunta a deliberare su determinati atti, può rogare tutti i contratti nei quali l'Ente è parte, cura, su richiesta del Sindaco, singoli atti e procedimenti che richiedano particolare attenzione giuridico-amministrativa.
Al Segretario Comunale, oltre alle competenze di legge, spetta, inoltre, l'esercizio di tutte le competenze proprie del Direttore Generale qualora sia stato investito di detto ruolo, il coordinamento degli apicali, qualora il Direttore Generale non sia stato nominato, la sostituzione del Direttore Generale in caso di assenza o impedimento, la presidenza dell'Ufficio di direzione, ove non esista il Direttore Generale, la decisione sui ricorsi gerarchici proposti avverso gli atti di competenza degli apicali, sempre se non esiste il Direttore Generale.

Il Direttore Generale è nominato dal Sindaco al di fuori della dotazione organica, con contratto a tempo determinato, secondo i criteri stabiliti dal regolamento di organizzazione degli uffici e dei servizi. La durata dell'incarico non può eccedere quella del mandato del Sindaco. Il Sindaco, sentita la Giunta Comunale, può conferire le funzioni di Direttore Generale al Segretario Comunale.
Il Direttore Generale provvede ad attuare gli indirizzi e gli obiettivi stabiliti dagli organi di governo dell'ente, secondo le direttive impartite dal Sindaco, sovrintende alla gestione dell'ente, perseguendo livelli ottimali di efficacia ed efficienza, predispone il piano dettagliato degli obiettivi dell'Ente, nonché la proposta del Piano Esecutivo di Gestione.
Al Direttore Generale rispondono, nell'esercizio delle funzioni loro assegnate, i Dirigenti dell'Ente e i responsabili preposti alle unità organizzative di massimo livello presenti nell'ente.

Il Segretario Generale e Direttore Generale del Comune di Novate Milanese è il Dr. Giovanni Capursi